En Nicaragua, así como en toda la región centroamericana, el ambiente está expuesto a impactos negativos debido tanto a los peligros naturales como por causa del desarrollo humano y el mal uso de los recursos naturales . Durante el proceso de reconstrucción que surgió después que el Huracán Mitch asoló la región en 1998, se vió con mas claridad que nunca la necesidad de contar con medidas de prevención, mayor planificación e iniciativas nuevas para reducir la situación de vulnerabilidad de la sociedad y del pais entero.

Todos estos factores fueron tomados en cuenta cuando el Programa Multidisciplinario de Investigación Ambiental fue iniciado en la Universidad Nacional Autónoma de Nicaragua (UNAN-Managua) con el apoyo de la Agencia Sueca de Cooperación Científica con los Países en Desarrollo (ASDI-Sarec) durante el período de 1998 a 2000. Este programa ha recibido la aprobación para un nuevo período (de 2001 a 2003) y las perspectivas de duración son de 7 a 8 años en total. En la actualidad se firmó un convenio de colaboración para el período Julio 2004 a Junio 2008.

Las contrapartes nicaragüenses son el Centro de Investigaciones Geocientíficas (CIGEO, Institución que coordina el programa), el Centro de Investigación para los Recursos Acuáticos (CIRA), la Facultad de Ciencias e Ingenierías y la Facultad de Ciencias Médicas. Las Contrapartes suecas son el Departamento de Ingeniería Geológica, el Departamento de Ecología, el Departamento de Medicina Ambiental y Ocupaciónal y el Departamento de Biotecnología de la Universidad de Lund.